徐州生物工程職業技術學院前身是創建于1956年的江蘇省徐州農業學校。2012年經江蘇省人民政府批準、教育部備案，升格為“徐州生物工程職業技術學院”，為公辦普通高等學校。學院目前是蘇北唯一的農業類普通高等院校、全省唯一的生物工程類職業技術學院。

目前，學校占地615畝，建筑面積21萬平方米。現有教職工335人，專任教師260人，其中副教授以上高級職稱74人，博士、碩士研究生137人，“雙師型”教師123人。建有生物技術、生物制藥、園藝園林、動物醫院、信息機電等30個實訓中心，200多個校外實訓基地，專業設備總值4300萬元，館藏圖書25萬冊。

學院設有農林工程系、動物工程系、生物工程系、信息工程系、機械工程系、電氣工程系、基礎部等6系1部，開辦26個大專專業，形成了以生物工程類專業為特色、農林牧醫類專業為優勢、機電信息類專業為支撐的專業結構。有2個中央財政支持專業（畜牧獸醫、園林技術）、1個江蘇省重點專業群（生物技術及應用專業群）、3個牽頭服務徐州“四大千億元產業”重點專業（園藝、園林、生物制藥）、1個徐州市重點實驗室（現代農業生物技術實驗室）、1個中心（徐州市風景園林工程研究中心），13個省市品牌、特色和示范專業。

學院堅持“立足徐州，面向淮海，建設職教名校”的發展戰略，堅持面向社會、緊貼市場的辦學方向，不斷推進教學改革，培養高素質技術技能型人才，形成校企合作、工學結合的人才培養模式。緊密對接企業，實施“教學合作、人才合育、文化互融、事業互促”的策略，與揚子江藥業、正大集團、中糧集團、溫氏集團、廣西桂柳等100多家大型企業建立了緊密型深層次合作關系，開展“訂單式”培養。注重學生綜合素質的提高和實踐能力、創業能力的培養，畢業生有較強的就業競爭力和發展后勁。建校以來，共培養大中專畢業生4萬多名，據不完全統計，目前徐連地區70%的農技推廣干部和30%的鄉鎮黨政主要干部均畢業于我院，就業率一直保持在98%以上。

學院是農業部A等學校、江蘇省技能型緊缺人才培訓基地、國家級職業技能鑒定站。現為全國農業職教專業委員會常務理事單位、江蘇省農牧職業院校生物工程類專業組長單位、江蘇省職業教育教科研中心組組長單位。近年來，獲得“全國服務農村青年增收成才先進集體”“中國可持續發展教育示范學校”“江蘇省職業教育先進單位”“江蘇省文明單位”“江蘇省平安校園”“江蘇省教育系統先進基層黨組織”“江蘇省教育回報社會先進單位”“江蘇省掛縣強農富民工程先進單位”“江蘇省園林式單位”“江蘇省花園式單位”“徐州市文明單位標兵”等榮譽稱號。